1、主要参数控制一般空调侧重温度、湿度、空气新鲜度的控制，而洁净空调除此之外还要求控制室内空气的含尘量、风速、换气次数等。

　　2、空气过滤措施一般空调只有粗效过滤、一级过滤，要求较高的有粗效、中效二级过滤，而洁净空调要求有粗、中、高效三级过滤，在有些洁净室中，还设有滤毒吸附过滤。

　　3、室内压力要求一般空调对室内空气无特殊要求，而洁净空调为避免外界污染空气的渗入或不同生产车间不同物质的相互影响，对不同洁净区的正压值均有不同的要求，在负压洁净室内尚有负压值的控制要求。

　　4、洁净空调系统材料和设备的选择要求洁净空调系统材料和设备的选择、加工工艺、加工安装环境、设备部件储存环境，为避免被外界污染，均有特殊的要求，为也是一般空调系统所没有的。